تاسیس دانشکده داروسازی شیراز در سال 1368 در شورای انقلاب فرهنگی تصویب شد و از سال تحصیلی 70 - 1369 در بلوار چمران (دانشکده توانبخشی فعلی) شروع به فعالیت و پذیرش دانشجو کرد. ریاست دانشکده از سال 1368 تا 1369 به عهده دکتر حسین نیک نهاد و از سال 1369 تا 1372 بر عهده دکتر غلامعباس دهقان و از سال 1372 تا 1375 به عهده دکتر محمد رضا پنجه شاهین بوده و از سال 1375 تا به حال بر عهده دکتر حسین نیک نهاد می باشد.

دانشکده داروسازی به جهت توسعه فضای آموزشی و آزمایشگاهی از سال 1380 به مکان فعلی (رکن آباد) منتقل گردید.

دانشکده داروسازی از ابتدای تاسیس فعالیت خود را با 5 گروه آموزشی فارماسیوتیکس، فارماکولوژی، فارماکوگنوزی، شیمی دارویی و کنترل فراورده های دارویی آغاز کرد. سپس گروه  داروسازی بالینی از سال 1383 ، گروه داروسازی سنتی از سال 1387 و گروه بیوتکنولوژی دارویی از سال 1388 به طور مستقل در دانشکده شروع به فعالیت نمود. در حال حاضر قسمت های مختلف داانشکده داروسازی در شش ساختمان(ساختمان 1 تا 6) گسترده می باشند. 

در حال حاضر 25 نفر عضو هیات علمی در این دانشکده مشغول به فعالیت می باشند.

راه اندازی دوره MS توکسیکولوژی از سال 1385 تصویب شده و از مهر 1386 پذیرش دانشجو در این رشته انجام می گردد.

راه اندازی دوره های PhD در رشته های شیمی دارویی، فارماسیوتیکس و داروسازی سنتی در سال 1386 تصویب شده و از مهر سال 1387 پذیرش دانشجو در اين دوره ها آغاز گردید.

راه اندازی دوره PhD در رشته بیوتکنولوژی دارویی در سال 1387 تصویب شده و از مهر سال 1388 پذیرش دانشجو در اين دوره ها آغاز گردید.

با توجه به افزایش تعداد دانشجویان و نیز افزایش تعداد اساتید دانشکده، گسترش فضاهای قابل بهره برداری دانشکده مورد توجه قرار گرفت. به این ترتیب از نیمسال تحصیلی جاری(89-1388) دو کلاس آموزشی به  فضای آموزشی دانشکده اضافه شده و نیز دفاتر اساتید و نیز دفتر جلسات در ساختمان اساتید ساخته شد.