تحصیلات تکمیلی دانشکده داروسازی از سال ۱۳۸۷ با موافقت دبیرخانه آموزش داروسازی و تخصصی و تصویب شورای گسترش دانشگاه های علوم پزشکی وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی با پذیرش دانشجو در سه رشته دکتری تخصصی( PhD) و یک رشته کارشناسی ارشد آغاز به کار نمود
در سال ۱۳۹۳ با تصویب دکتری تخصصی نانو فناوری دارویی و داروسازی بالینی تعداد رشته ها در مقطع  PhD از ۶ رشته به ۸ رشته ارتقا یافته است.
فهرست رشته های تحصیلات تکمیلی مصوب در دانشکده داروسازی شیراز: